Bakteriyel leke hastalığına neden olan Xanthomonas izolatlarının tür düzeyinde tanısı

Abstract

Bilimsel amaçlı biyolojik çalışmaların başlangıç noktası olan taksonomi, bir canlının diğer canlılarla akrabalık ilişkilerini ortaya koymaktadır. Taksonomi doğal olarak değişenlik gösterebildiği gibi, yeni teknolojiler, metotlar ve kavramlarla da değişebilir. Diğer canlı türlerinde olduğu gibi bakterilerde de sınıflandırma ve isimlendirmeler gelişen moleküler teknikler ile beraber değişebilmektedir. Sistematiğinde değişiklik olan ve yeni türlere ayrılan bakteriyel etmenlerden biri de domates ve biberde Bakteriyel Leke Hastalığı etmeni Xanthomonas campestris pv. vesicatoria (Syn Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria)’dır. Patojen, yeni moleküler tekniklerin ışığında dört türe ayrılmıştır. DNA homolojisine göre yapılan analizlerde Xanthomonas euvesicatoria, Xanthomonas vesicatoria, Xanthomonas perforans ve Xanthomonas gardneri olarak isimlendirmiştir. Bu çalışma kapsamında; Adana, Antalya ve Mersin illerinde açık alan ve örtü altında yetiştirilen domates ve biberlerden, fideliklerden ve biber tohumlarından 2004-2021 yılları arasında izole edilmiş 66 adet Xanthomonas campestris pv. vesicatoria izolatı klasik PCR testi kullanılarak yeniden sınıflandırılmıştır. Yapılan Klasik PCR testinde izolatların %91’i (60 izolat) Xanthomonas euvesicatoria olarak ve %9’u (6 izolat) ise Xanthomonas perforans olarak saptanmıştır. Bu makale Xanthomonas perforans’ın Doğu Akdeniz Bölgesi’nde (Adana ve Mersin illeri) varlığını ortaya koyan ilk çalışma niteliğindedir.